地方政府在区域合作中的选择决定了区域化发展的进程。通过对安徽区域化发展中政府合作的发展历程描述，分析了地方政府之间因利益博弈而产生的合作困境。基于此提出提升中心城市的发展和合作，强化省级政府公共服务均等化建设能力，以考核指标的改革促进地市政府之间的利益协调等来推进政府的合作。